Filmen 'To minutters stilhed' handler om en gruppe gymnasieelever i den østtyske by Stalinstadt i året 1956, som vil vise deres solidaritet med ofrene fra en opstand i Ungarn.

Da jerntæppet strammes, bliver der slået hårdt ned på oprørere i Ungarn af de sovjetiske besættelsesstyrker i landet. Dette fører til, at de unge gymnasieelever holder to minutters stilhed for de faldne.

Skoleledelsen reagerer voldsomt på elevernes opførsel, da der ikke tolereres systemkritik. De unge bliver bedt om at udpege bagmanden for oprøret, ellers vil de alle bliver smidt ud af skolen.

Hvad der startede som en spontan solidarisk reaktion hos nogle elever i efterkrigstidens Østtyskland ender med at tiltrække sig opmærksomhed helt fra toppen af regeringen.

'To minutters stilhed' bygger på virkelige begivenheder og er baseret på romanen af Dietrich Garstka. Instruktøren har tidligere stået bag det tyske periodedrama Fritz Bauer: En fjende af staten.